Перед авиационными конструкторами всегда стояла задача повышения потолка самолетов. Для бомбардировщиков и разведчиков это снижало их уязвимость, для истребителей — способствовало перехвату высотной цели. У МиГ-19СВ практический потолок не превышал 18 500 м. Более высотные цели, в том числе и стратегический разведчик «Локхид» U-2, полеты которого над СССР начались в конце 1950-х годов, перехватить он не мог.
Еще в 1954 году мартовским постановлением правительства ОКБ-155 предписывалось разработать «экспериментальный самолет для исследовательских полетов со сверхзвуковыми скоростями» на больших высотах. Заданием предусматривалось установить на МиГ-19 с двигателями АМ-9 дополнительный жидкостный ракетный двигатель с тягой 4 000 кг. Предполагалось, что при этом удастся достичь скорости 1 800—2 000 км/ч на высотах 20—22 км. Время набора этой высоты оценивалось в 5 мин, а суммарная продолжительность полета не превышала 25—30 мин. Но эта идея так и осталась на бумаге.
Однако позднее к высотному варианту МиГ-19 вернулись. В соответствии с постановлением Совета Министров от 25 августа 1956 года начались работы по истребителям, получившим впоследствии обозначения СМ-50 и СМ-52.
За основу взяли МиГ-19С, с которого демонтировали фюзеляжную пушку и ракетные установки ОРО-57К, топливные баки №3 и №4 (при этом допускалась установка подвесных топливных баков, но только для полетов с незаправленным ускорителем У-19). Сняли также часть оборудования, в том числе ракетницу ЭСКР-46, радиовысотомер РВ-2, станцию «Сирена-2», предупреждавшую об облучении машины сзади радаром самолета противника, противопожарное оборудование, тормозной парашют, а для наведения перехватчика на цель с земли установили опытную аппаратуру «Каскад».
Было изменено расположение антенн маркерного радиоприемника МРП-56П и радиокомпаса АРК-5. С учетом того, что полеты станут выполняться на высотах около 25 000 м, комплект кислородного оборудования ККО-1 заменили на ККО-2, поставили новые барометрический высотомер и указатель числа Маха. В экипировку летчика ввели высотно-компенсирующий костюм ВКК-3.
Вместо двигателей РД-9Б установили РД-9БМ с регулированием тяги на форсажном и максимальном режимах, а под фюзеляжем появился сбрасываемый ускоритель одноразового действия У-19, в связи с чем подфюзеляжный киль заменили двумя, вынеся их из области воздействия газовой струи ракетного двигателя.
В ускорителе использовался двухрежимный ЖРД С3-20М с самовоспламеняющимся топливом, разработанный в ОКБ-3 (НИИ-88) под руководством Д.Д. Севрука и развивавший тягу 3 200 кг в течение 30 с. Несмотря на все преимущества использования ЖРД, на СМ-50 оказался совершенно не продуман процесс его наземной подготовки. Зачастую высокотоксичные компоненты топлива сливали прямо на землю, отравляя не только окружающую среду, но и обслуживающий персонал.
21 ноября 1956 года первый СМ-50, он же МиГ-19СУ (заводской №61210310), переоборудованный на заводе №155 (опытном заводе ОКБ Микояна), передали на заводские испытания. Первый полет на нем выполнил летчик-испытатель В.А. Нефедов. Второй самолет (№61210319), изготовленный в Горьком, поступил на заводские испытания 19 февраля 1957 г. Несколько полетов на этом этапе выполнил Г.А. Седов, достигнув в одном из них динамического потолка 24 500 м. От ЛИИ на самолете летали А.П. Богородский, В.П. Васин, М.М. Котельников, В.Г. Мухин и А.А. Щербаков.
До появления СМ-50 испытывался перехватчик Е-50 аналогичного назначения, тоже со смешанной силовой установкой, но с треугольным крылом. 8 августа 1957 года на этой машине, выполняя седьмой полет с аэродрома Раменское, погиб летчик-испытатель ГК НИИ ВВС Н.А. Коровин.
«В этот день, — рассказывал заслуженный летчик-испытатель П.Ф. Кабрелев, — мы возвращались с аэродрома Кубинка после показа авиационной техники Н.С. Хрущеву, когда, совершенно случайно, из передачи одной из зарубежных радиостанций узнали о гибели Николая Аркадиевича. Поразительно, но по возвращении в Чкаловскую об этом еще никто не знал, более того никто не поверил в это сообщение. Однако это было так. Уже после гибели Коровина к нам поступил самолет СМ-50. Сами же испытания приказали проводить подальше от Москвы, на аэродроме Севастлейка, где находится Центр боевого применения и переучивания летного состава ПВО страны. Это, безусловно, было неудобно, зато разведывательная информация в западные средства массовой информации если и попадала, то с большим опозданием».
Ведущими на государственных испытаниях (с 9 января по 9 апреля 1958 года) были инженер В.П. Белодеденко и летчики-испытатели П.Ф. Кабрелев и С.В. Петров. СМ-50 мог эксплуатироваться как с ускорителем У-19, так и без него. Обычно ускоритель после окончания работы сбрасывался, и, израсходовав их запас (хватило на 44 полета из 68), испытания прекратили. Кроме специалистов ГК НИИ ВВС, в испытаниях участвовали летчик-испытатель ОКБ В.А. Нефедов (два полета), летчики ПВО А.Л. Иванов (15 полетов), И.И. Павлов (11 полетов) и генерал-полковник Е.Я. Савицкий (два полета). 23 старта пришлось на долю П.Ф. Кабрелева.
Пилоты отмечали, что после включения ускорителя на высоте около 17 000 м вертикальная скорость нередко доходила до 120 м/с. В ходе испытаний была достигнута высота 24 000 м и скорость, более чем в 1,6 раза превышающая звуковую. На высотах 20 000 м и 22 000 м летчики пытались выполнять горизонтальные «площадки» с работающим ускорителем, но их продолжительность не превышала 100 и 67 секунд соответственно. Время набора такой высоты изменялось от 9,5 до 11 мин. Особую сложность в технике пилотирования истребителя представлял вывод его на заданную высоту, так как по условиям устойчивости работы ЖРД перегрузка не должна была быть ниже 0,3—0,5 единицы — иначе возникали проблемы с подачей компонентов топлива.
Увеличение массы снаряженного самолета привело к значительному увеличению скорости отрыва от земли на взлете, достигшей 395 км/ч. Повышенное внимание уделялось колесам шасси. Лопни одно из них на разбеге, из-за малого расстояния между самолетом и землей ускоритель, наполненный ядовитыми компонентами ракетного топлива, стал бы «царапать» полосу. А это могло привести к катастрофе.
В качестве высотных целей в ходе испытаний использовались облегченный МиГ-19СВ и позднее — второй СМ-50.
Постановлением правительства №419-198 от 16 апреля 1958 года завод №21 обязали оборудовать ускорителями конструкции Севрука 40 МиГ-19П, но этот заказ так и остался невыполненным. Кроме СМ-50, доработанного в Москве, еще четыре машины (№№61210319, 61210320, 61210401 и 61210402) изготовили в Горьком.
Для второй половины 1950-х годов характеристики, полученные в ходе испытаний этого перехватчика, были довольно высоки. Чтобы эффективно использовать располагаемый суммарный импульс двигателей, требовалось точно выбрать момент его включения и правильно задать программу полета в сочетании с точным наведением на цель с земли. Однако визуально обнаружить цель на высотах более 20 000 м, поймать ее в прицел и поразить с одного захода пушечным огнем в течение полуминуты было практически невозможно. В те годы оставляли желать лучшего и сами методы наведения перехватчика на цель, опиравшиеся больше на глазомер, чем на еще «сырую» аппаратуру наведения «Каскад».
Задачу высотного перехвата не смогли решить и самолеты СМ-51 и СМ-52 (СМ-50П). Первый из них отличался от СМ-50 только наличием радиолокационной станции. Заводские испытания его проходили летом 1958 года. Вооружение оставалось пушечным. На СМ-52 устанавливались двигатели Р3-26 и ускоритель У-19Д с ЖРД конструкции Севрука. Самолет, оснащенный управляемыми ракетами РС-2-У и РЛС «Алмаз», требовал относительно продолжительного сопровождения цели. Он тоже прошел заводские испытания, ведущими на которых были инженер Ю.Н. Королев и летчик К.К. Коккинаки. Испытания позволили изучить особенности пилотирования самолета и поведения двигателей на высотах до 24 000 м.
Опытные образцы СМ-51 и СМ-52 строились на заводе №21 в Горьком. Спорная эффективность обоих высотных перехватчиков не позволила запустить их в серийное производство.